Prijepolje preseca dolina Lima pravcem jugoistok – severozapad, sa kojom se povezuje veci broj manjih reka. Na dodiru reka Lima i Mileševke, sa njihove desne strane, na prostorima recnih terasa i aluvijalnih ravni razvilo se staro Prijepolje. Prijepolje i njegova okolina su aktivno povezani sa susednim mestima Crne Gore i Srbije.

Juzno od Prijepolja, dolinom Lima put ide prema Bijelom Polju, udaljenom oko 55 km i dalje Mojkovcu, Kolašinu, Podgorici i Baru, a severno od Prijepolja prema Bistrici udaljenoj 10 km, gde se put racva u dva smera, jedan prema Novoj Varoši udaljenoj od Prijepolja oko 27 km i drugi prema Priboju udaljenom oko 30 km, koji dalje preko planine Zlatibor ide prema Uzicu, Pozegi, Kosjericu, Valjevu, Beogradu i drugim mestima.

Zapadno od Prijepolja put vodi dolinom Seljašnice preko planinske visoravni Jabuke prema Pljevljima udaljenim oko 30 km, a istocno od Prijepolja dolinom Mileševke i planine Jadovnik prema Sjenici, udaljenoj oko 30 km i dalje prema Novom Pazaru, Prištini i Skoplju.

Prijepolje se smestilo na dodiru maritimnih i kontinentalnih vazdušnih masa. Od mora je vazdušnom linijom udaljeno 140 km, a od Panonske nizije 160 km. Medjutim, izmedju Jadranskog mora i Panonske nizije isprecili su se visoki planinski venci cija visina mestimicno prelazi i preko 2500 m. Oni sprecavaju dublje prodiranje kontinentalnih i maritimnih uticaja na prostoru prijepoljskog kraja. Stoga se Prijepolje moze ubrajati u gradove sa umerenom – kontinentalnom klimom koja je znatno modifikovana reljefnim uticajem. Središnja godišna temperatura je oko 9,3°C. Srednje najnize temperature vazduha su u januaru oko -2,8°C, dok su srednje najviše u julu sa oko 19,1°C.

Srednja godišnja kolicina atmosferskih padavina u Prijepolju iznosi oko 789,5 mm/m² površine. Medjutim, za vegetaciju je mnogo znacajniji raspored kiša po mesecima, intezitetu i gustini padavina. Najveca kolicina padavina se izluci tokom leta i jeseni a najmanja tokom zime i proleca… Lim je najveca reka Prijepoljskog kraja te su svi manji vodeni tokovi upravljeni prema njemu. On ima odlike kompozitne doline jer se u njoj izmedju Bijelopoljske i Pribojske kotline, naizmenicno smenjuju klisure sa recnim proširenjima – kotlinama.

Sa leve strane u Lim se ulivaju Gostunska, Slatinska, Komaranska reka, Gracanica, Mioska, Ratajska, Seljašnica i Ljupca a s desne Grobnicka, Stranjanska, Dubocica, Kruševica, Ribnjak, Zebudja, Mileševka i Bistrica. Najveci broj istih ima bujicni karakter …